Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933436I01RikQ9D3T1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms