Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx11Q9D3G5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms