Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms