Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx20Q9D2Y5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx20Q9D2Y5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx20Q9D2Y5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx20Q9D2Y5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx20Q9D2Y5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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