Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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