Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps28Q9D1C8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms