Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Mrpl28Q9D1B9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Mrpl28Q9D1B9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Mrpl28Q9D1B9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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