Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18l2Q9D174 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18l2Q9D174 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18l2Q9D174 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ss18l2Q9D174 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms