Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms