Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Acbd6Q9D061 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acbd6Q9D061 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms