Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms