Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms