Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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