Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms