Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sugt1Q9CX34 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sugt1Q9CX34 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms