Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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