Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkrip1Q9CWV6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms