Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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