Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms