Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms