Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms