Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms