Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tma16Q9CR02 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tma16Q9CR02 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms