Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16286Q9CQX6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms