Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PclafQ9CQX4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms