Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Nicn1Q9CQM0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nicn1Q9CQM0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nicn1Q9CQM0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nicn1Q9CQM0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nicn1Q9CQM0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nicn1Q9CQM0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nicn1Q9CQM0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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