Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms