Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufb5Q9CQH3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb5Q9CQH3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms