Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms