Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rab5aQ9CQD1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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