Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole4Q9CQ36 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole4Q9CQ36 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms