Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms