Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Chmp3Q9CQ10 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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