Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms