Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sike1Q9CPR7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms