Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn6Q99PL6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms