Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NsmfQ99NF2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms