Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms