Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atoh8Q99NA2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms