Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6cQ99N08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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