Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp26Q99MX1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp26Q99MX1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp26Q99MX1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp26Q99MX1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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