Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms