Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms