Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5rap3Q99LM2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms