Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nus1Q99LJ8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms