Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab28Q99KL7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms