Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp11Q99K46 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms