Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krcc1Q99JT5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms