Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms