Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms